El Ministeri d'Educació desenvolupa un conjunt de plans i programes de cooperació amb les comunitats autònomes que té com a objectiu la contribució a la millora del sistema educatiu en aspectes que es consideren essencials per a l'augment de la qualitat de l'educació. A través d'aquests plans i programes es contribueix a millorar la capacitat de les administracions educatives per plantar cara als reptes a què han d'enfrontar-se, en molts casos aportant fons per cofinançar actuacions de les conselleries i departaments d'Educació.